<< Tillbaka
   
Allmänt
- Om ViennaLab
  - ViennaLab StripAssay
  - ViennaLab Realfast™ Assay
   
Genetiskt betingade sjukdomar
Thalassemi
  - a-Globin Thalassemi Strip Assay
  - b-Globin Thalassemi Strip Assay
  -Beta-Thai Modifier Strip Assay
Hemokromatos
  - Hemokromatos Strip Assay  A
  - Hemokromatos Strip Assay  B
  - Realfast Assay Hemokromatos 
   
Familjär medelhavsfeber
  - FMF Strip Assay
   
Sockerintolerans
  - Sugar Intolerance Strip Assay
  - Lactose Intolerance Strip Assay
  - Realfast Assay Laktosintolerans
   
Gaucher Disease
  - Gaucher Disease Strip Assay
   
Kongenital adrenohyperplasi (CAH)
- Kongenital adrenohyperplasi (CAH) Strip Assay
- Realfast Assay Kongenital adrenohyperplasi (CAH)
Cystisk fibros
- Cystisk fibros CF Strip Assay
   - Cystisk fibros CF Strip Assay TUR
   - Cystisk fibros CF Strip Assay GER
   
Genetisk predisposition
Kardiovaskulär sjukdom
- CVD relaterade Strip Assays
  - CVD Strip Assay
  - PGX-Trombo Strip Assay
- RealFast™ Assay VKORC1 -1639G>A
- RealFast™ Assay FV Leiden
- RealFast™ Assay PTH 20210G>A
- RealFast™ Assay MTHFR 677C>T
- RealFast™ Assay MTHFR 1298A>C
- RealFast™ Assay PAI-1 4G/5G
  - ApoE Strip Assay
 
Alzheimers sjukdom
  - ApoE Strip Assay
 
Spondylit m.m.
  - HLA-B27 Strip Assay
  - RealFast™ HLA-B27
 
Farmakogenomik
 
  - PGX-NRAS Strip Assay
  -FCGR Strip Assay
  - PGX-CYP2C19 Strip Assay
  - PGX-P450 CYP 2D6 Strip Assay
- PGX-HIV Strip Assay
  - RealFast™ Assay HLA-B5701
 
- PGX-Trombo Strip Assay
 
Tillbehör
  - Mjukvara Strip Assay evaluator
   
 
   
 
   
   
   
 
Viennalab - Navigeringsmeny

Farmakogenomik
PGX – KRAS och PGX-BRAF StripAssays

KRAS, BRAF och NRAS har en vital roll i cellsignaleringen där epidermal growth factor receptor (EGFR) är involverad. Muterade former är potenta inom onkogenesen vilket man har funnit vid många cancertyper hos människa (t.ex. colorectalcancer, pankreas-cancer, lungcancer, leukemi).
 
Modern cancerbehandling kan effektivt bekämpa metastaserad kolorektalcancer. Bäst resultat uppnås när en specifik typ av cancer matchas med mest lämplig terapi. Terapier mot metastaserad kolorektalcancer med monoklonala antikroppar riktade mot EGFR (såsom cetuximab och panitumumab) fungerar utomordentligt väl i många fall. Men inte i alla.
Vissa mutationer i KRAS-genen förhindrar effekt med terapier som är riktade mot EGFR. Epidermal tillväxtfaktor (EGF) aktiverar cellproliferation genom bindning till EGF-receptor (EGFR). Detta triggar en signaltransduktionsväg som inbegriper KRAS-proteinet. Hämning av EGFR med monoklonala antikroppar förhindrar aktivering av den relevanta signaltransduktionen precis i början av cykeln. Men det fungerar bara om andra delar av den vägen inte är permanent aktiverade oavsett EGF-signalen. Mutationer i KRAS kan orsaka denna typ av aktivering som gör anti-EGFR terapier ineffektiva.
KRAS genen i människa kodar för en homolog av en transformationsgen isolerad från Kirsten rat sarcoma virus. Likt andra inom ras gen familjen (H-ras, N-ras), är KRAS proteinet ett 21 kD GTPas och utgör en tidig aktör i många signaltranduktions-vägar.
Wildtype KRAS har en vital roll i den normala cellsignaleringsprosessen, inklusive prolifiering, differentiering och åldrande. Muterade former av genen är potenta inom onkogenesen vilket man har funnit vid många cancertyper hos människa (t.ex. colorectalcancer, pankreas-cancer, lungcancer, leukemi). Den mest kritiska regionen för KRAS genen för onkologisk aktivering är mutationer i codon 12 och 13, som orsakar att proteinet lagras i ett aktivt GTP-bundet tillstånd. 
KRAS mutationer har visat sig vara prediktiva för den respons som kan åstadkommas vid cancerterapi med anti-EGFR monoklonala antikroppar, som t.ex. panitumumab/Vectibix®, cetuximab/Erbitux® och tyrosinkinas inhibitorer (erlitinib/Tarceva®, gefitinib/Iressa®).
Epidermal tillväxtfaktor (EGF) aktiverar cellproliferation genom bindning till EGF-receptor (EGFR). Detta utlöser en signaltransduktionsväg som omfattar KRAS-och BRAF-proteiner. Hämmande EGFR med monoklonala antikroppar eller små molekyler terapeutika förhindrar aktivering av den relevanta signaltransduktion precis i början av cykeln. Men detta fungerar bara om andra delar av vägen inte är permanent aktiverade oavsett EGF-signal. Mutationer i KRAS och BRAF kan orsaka denna typ av aktivering som gör anti-EGFR terapier ineffektiva.
Moderna cancerbehandlingar kan effektivt bekämpa sköldkörtelcancer och melanom. De bästa resultaten uppnås när en specifik typ av cancer matchas mot den bäst lämpade behandlingen. Identifiering av mutationer i onkogener bidrar med väsentlig information för att identifiera en effektiv metod.
Mutationer i BRAF-genen skulle kunna bidra till progressionen av sköldkörtelcancer och melanom. BRAF kodar för ett serin/treoninkinas som är en nyckelfaktor i mitogenaktiverat proteinkinas som omvandlar signalerna från Ras onkogener. BRAF-mutationer har rapporterats i sköldkörtelcancer, melanom och i vissa andra cancerformer. Vissa mutationer öka kinasaktiviteten avsevärt och därigenom kan de kontinuerligt aktivera transkriptionsmedierad proliferation, som stöd för neoplastisk tillväxt.

KRAS Strip Assay® 5-590 detekterar:
Kodon 12: Ala, Arg, Asp, Cys, Ile, Leu, Ser, Val
Kodon 13: Asp, Cys

KRAS XL Strip Assay® är en uppdaterad och utökad version av KRAS och KRAS 12/13/61 StripAssay, täcker mutationer i exon 2 (kodon 12/13), exon 3 (kodon 59/60/61) och exon 4 (kodon 117/146). KRAS XL StripAssay" omfattar alltså alla tre kritiska KRAS exoner som behöver utredas enligt gällande riktlinjer från olika patologi sammanslutningar och läkemedelsföretag (Merck, Amgen). KRAS XL Strip är avsett för att detektera:
Kodon 12: Ala, Arg, Asp, Cys, Ile, Leu, Ser, Val
Kodon 13: Ala, Arg, Asp, Cys, Ser, Val
Kodon 59: Glu, Gly, Thr
Kodon 60: Val
Kodon 61: Arg, His, Leu, Lys
Kodon 117: Asn, Glu
Kodon 146: Thr, Pro, Val


KRAS XL Strip assay
BRAF testning hamnade i focus när de europeiska och amerikanska organen EMEA och FDA godkände Vemurafenib (Zelboraf/Roche) för behandling av metastatiskt melanom. Vemurafenib är en potent BRAF inhibitor och som är effektiv för patienter som bär mutation i BRAF codon 600/601. Utöver Vemurafenib finns under utveckling andra droger som riktas mot muterad BRAF, som t.ex. Dabrafenib, som förväntas sättas på marknaden i en nära framtid.
Bland BRAF mutationer är V600E (tidigare benämnd V599E) särskilt ofta iakttagen (>90%). BRAF V600E har också visats vara prediktiv för respons vid behandling med vissa anti-EGFR monoklonala antikroppar såsom t.ex. cetuximab/Erbitux och panitumumab/Vectibix, som godkänts för terapi vid colorectalcancer. Studier har visat att verkan av behandlingen med dessa antikroppar är begränsad till patienter med BRAF wild type tumörer. BRAF V600E screening har dessutom beskrivits som en kostnadseffektiv väg för att förenkla genetisk testning för hereditär non-polyposis colorectalcancer (HNPCC).

BRAF V600E StripAsssay®
5-570
V600E (c.1799T> A)

BRAF 600/601 StripAssay 5-560
V600A (c.1799T> C),
V600D (c.1799_1800TG> AT),
V600E (c.1799T> A),
V600E (c.1799_1800TG> AA),
V600G (c.1799T> G),
V600K (c.1798_1799GT> AA),
V600M (c.1798G> A),
V600R (c.1798_1799GT> AG),
K601E (c.1801A> G)


BRAF 600/601 StripAssay

Muterade alleler är detekterbara vid en förekomst av mindre än 1 % i en bakgrund av wild-type.

Strip Assay kiten innehåller bruksfärdigt reagens till 20 tester. Analysen kan utföras i tre enkla steg på mindre än 6 timmar, manuellt eller automatiserat.
 

Kiten är baserade på revers-hybridisering av biotinylerade PCR produkter till en parallellarray med allel-specifika oligonukleotider immobliserade på ett membranteststrip. Denna strips assay har bruksfärdiga reagens för genomförande av följande tre steg:

1.     PCR för amplifiering av mutant KRAS codon 12 och 13 och BRAF V600E sekvenser i närvararo av wild-type supressor.

2.     Hybridisering av biotinilerade amplifierings-produkter till oligonukleotid proberna på testremsan.

3.     Detektering av specifikt bundna mutanter av KRAS alleler och PCR kontroll med en synlig enzymatisk färgreaktion.

En av två möjliga reaktioner kan avläsas:

1.     Alla KRAS prober är negativa, kontrollen positiv: - ingen av KRAS mutationerna finns närvarande.

2.     En eller flera KRAS prober positiva, kontrollen positiv: - en eller flera KRAS mutationer förekommer.

Best.nr. Benämning Specifikation
5-590 PGX-KRAS StripAssay KRAS Strip Assay, för högkänslig detektering av muterade KRAS alleler
5-680 PGX-KRAS XL StripAssay KRAS Strip Assay, för högkänslig detektering av muterade KRAS alleler
5-580 PGX-KRAS - BRAF StripAssay KRAS Strip Assay, för högkänslig detektering av muterade KRAS och BRAF alleler
5-570 PGX-BRAF StripAssay BRAF Strip Assay, för högkänslig detektering av muterad BRAF
5-560 PGX- BRAF 600/601 StripAssay BRAF 600/601 Strip Assay, för högkänslig detektering av muterade KRAS och BRAF alleler